Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nck2O55033 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nck2O55033 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nck2O55033 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nck2O55033 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nck2O55033 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nck2O55033 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nck2O55033 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nck2O55033 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nck2O55033 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nck2O55033 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nck2O55033 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nck2O55033 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nck2O55033 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nck2O55033 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nck2O55033 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms