Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Limk2O54785 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Limk2O54785 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Limk2O54785 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Limk2O54785 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limk2O54785 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Limk2O54785 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms