Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Srpk2O54781 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Srpk2O54781 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Srpk2O54781 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Srpk2O54781 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Srpk2O54781 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Srpk2O54781 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Srpk2O54781 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Srpk2O54781 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Srpk2O54781 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Srpk2O54781 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Srpk2O54781 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Srpk2O54781 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Srpk2O54781 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Srpk2O54781 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Srpk2O54781 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Srpk2O54781 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Srpk2O54781 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Srpk2O54781 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Srpk2O54781 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Srpk2O54781 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Srpk2O54781 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Srpk2O54781 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Srpk2O54781 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms