Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccr6O54689 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms