Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cops5O35864 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cops5O35864 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cops5O35864 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cops5O35864 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cops5O35864 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops5O35864 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cops5O35864 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cops5O35864 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cops5O35864 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cops5O35864 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms