Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timm44O35857 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timm44O35857 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timm44O35857 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timm44O35857 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timm44O35857 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Timm44O35857 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Timm44O35857 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timm44O35857 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timm44O35857 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Timm44O35857 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Timm44O35857 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Timm44O35857 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timm44O35857 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Timm44O35857 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms