Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf9O35739 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf9O35739 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf9O35739 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf9O35739 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf9O35739 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf9O35739 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klf9O35739 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms