Protein–RNA interactions for Protein: O35719

Rad51b, DNA repair protein RAD51 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51bO35719 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad51bO35719 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad51bO35719 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms