Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx1aO35526 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx1aO35526 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms