Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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Prrt1O35449 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt1O35449 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms