Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bhlhe40O35185 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe40O35185 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms