Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Nedd9O35177 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Nedd9O35177 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nedd9O35177 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nedd9O35177 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nedd9O35177 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nedd9O35177 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nedd9O35177 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nedd9O35177 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nedd9O35177 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nedd9O35177 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
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Nedd9O35177 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Nedd9O35177 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nedd9O35177 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Nedd9O35177 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Nedd9O35177 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nedd9O35177 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Nedd9O35177 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nedd9O35177 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Nedd9O35177 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nedd9O35177 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Nedd9O35177 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nedd9O35177 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nedd9O35177 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nedd9O35177 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nedd9O35177 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Nedd9O35177 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Nedd9O35177 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nedd9O35177 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nedd9O35177 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nedd9O35177 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
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Nedd9O35177 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nedd9O35177 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nedd9O35177 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nedd9O35177 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nedd9O35177 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms