Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pitx3O35160 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms