Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ArxO35085 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ArxO35085 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ArxO35085 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ArxO35085 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ArxO35085 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ArxO35085 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ArxO35085 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ArxO35085 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ArxO35085 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ArxO35085 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ArxO35085 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ArxO35085 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ArxO35085 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ArxO35085 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ArxO35085 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ArxO35085 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ArxO35085 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ArxO35085 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ArxO35085 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ArxO35085 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ArxO35085 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ArxO35085 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ArxO35085 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ArxO35085 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ArxO35085 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ArxO35085 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ArxO35085 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ArxO35085 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ArxO35085 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ArxO35085 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ArxO35085 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ArxO35085 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ArxO35085 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ArxO35085 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ArxO35085 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ArxO35085 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ArxO35085 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ArxO35085 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ArxO35085 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ArxO35085 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ArxO35085 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ArxO35085 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ArxO35085 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ArxO35085 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ArxO35085 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ArxO35085 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ArxO35085 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ArxO35085 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ArxO35085 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ArxO35085 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ArxO35085 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ArxO35085 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ArxO35085 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ArxO35085 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ArxO35085 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ArxO35085 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ArxO35085 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ArxO35085 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ArxO35085 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ArxO35085 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ArxO35085 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ArxO35085 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ArxO35085 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ArxO35085 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ArxO35085 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ArxO35085 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ArxO35085 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ArxO35085 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ArxO35085 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ArxO35085 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ArxO35085 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ArxO35085 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ArxO35085 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ArxO35085 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ArxO35085 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ArxO35085 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ArxO35085 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ArxO35085 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ArxO35085 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ArxO35085 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ArxO35085 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ArxO35085 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ArxO35085 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ArxO35085 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ArxO35085 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ArxO35085 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ArxO35085 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ArxO35085 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ArxO35085 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ArxO35085 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ArxO35085 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ArxO35085 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ArxO35085 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ArxO35085 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ArxO35085 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ArxO35085 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ArxO35085 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ArxO35085 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ArxO35085 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms