Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

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Length 796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif3cO35066 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kif3cO35066 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kif3cO35066 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kif3cO35066 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kif3cO35066 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Kif3cO35066 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3cO35066 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3cO35066 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3cO35066 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3cO35066 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Kif3cO35066 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3cO35066 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3cO35066 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3cO35066 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif3cO35066 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif3cO35066 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif3cO35066 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif3cO35066 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif3cO35066 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif3cO35066 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif3cO35066 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif3cO35066 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif3cO35066 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif3cO35066 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif3cO35066 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif3cO35066 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kif3cO35066 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif3cO35066 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif3cO35066 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif3cO35066 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif3cO35066 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms