Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn4O35054 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms