Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkcshO08795 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PrkcshO08795 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms