Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tcof1O08784 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tcof1O08784 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcof1O08784 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms