Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema3aO08665 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema3aO08665 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema3aO08665 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema3aO08665 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema3aO08665 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema3aO08665 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sema3aO08665 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema3aO08665 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema3aO08665 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema3aO08665 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema3aO08665 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema3aO08665 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema3aO08665 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema3aO08665 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema3aO08665 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema3aO08665 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema3aO08665 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema3aO08665 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema3aO08665 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema3aO08665 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema3aO08665 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema3aO08665 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema3aO08665 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema3aO08665 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema3aO08665 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema3aO08665 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms