Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MsmbO08540 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MsmbO08540 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MsmbO08540 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MsmbO08540 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MsmbO08540 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MsmbO08540 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MsmbO08540 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MsmbO08540 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms