Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r88L7N1W8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r88L7N1W8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r88L7N1W8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r88L7N1W8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r88L7N1W8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r88L7N1W8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r88L7N1W8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r88L7N1W8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r88L7N1W8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r88L7N1W8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms