Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Gm21310J3QQ23 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gm21310J3QQ23 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm21310J3QQ23 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm21310J3QQ23 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm21310J3QQ23 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21310J3QQ23 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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