Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU0

Spin2f, Spindlin family, member 2F, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2fJ3QPU0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spin2fJ3QPU0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Spin2fJ3QPU0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms