Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY1

Gm9242, Predicted pseudogene 9242, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9242J3QNY1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9242J3QNY1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9242J3QNY1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9242J3QNY1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9242J3QNY1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9242J3QNY1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9242J3QNY1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9242J3QNY1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9242J3QNY1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9242J3QNY1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm9242J3QNY1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm9242J3QNY1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm9242J3QNY1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm9242J3QNY1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm9242J3QNY1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm9242J3QNY1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm9242J3QNY1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm9242J3QNY1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm9242J3QNY1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm9242J3QNY1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm9242J3QNY1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm9242J3QNY1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm9242J3QNY1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm9242J3QNY1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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