Protein–RNA interactions for Protein: J3QNU5

Gm21798, Predicted gene, 21798, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21798J3QNU5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21798J3QNU5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms