Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21972J3QN38 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms