Protein–RNA interactions for Protein: J3QJZ1

Gm21969, Predicted gene 21969, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21969J3QJZ1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm21969J3QJZ1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm21969J3QJZ1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms