Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20830J3KML6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20830J3KML6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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