Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20815J3KMI0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20815J3KMI0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20815J3KMI0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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