Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3tc1G3X9F6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3tc1G3X9F6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3tc1G3X9F6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms