Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Slc9a3G3X939 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc9a3G3X939 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc9a3G3X939 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms