Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim15G3UY57 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms