Protein–RNA interactions for Protein: G3UW87

Gm17455, MCG55969, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17455G3UW87 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm17455G3UW87 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm17455G3UW87 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm17455G3UW87 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm17455G3UW87 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm17455G3UW87 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17455G3UW87 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms