Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn34aG3UW52 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms