Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp72F8VQC1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Srp72F8VQC1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Srp72F8VQC1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Srp72F8VQC1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Srp72F8VQC1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Srp72F8VQC1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Srp72F8VQC1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Srp72F8VQC1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Srp72F8VQC1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Srp72F8VQC1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Srp72F8VQC1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Srp72F8VQC1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Srp72F8VQC1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Srp72F8VQC1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Srp72F8VQC1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Srp72F8VQC1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Srp72F8VQC1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Srp72F8VQC1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Srp72F8VQC1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Srp72F8VQC1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Srp72F8VQC1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Srp72F8VQC1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Srp72F8VQC1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms