Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ScaperF8VQ70 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ScaperF8VQ70 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ScaperF8VQ70 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms