Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Farp1F8VPU2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Farp1F8VPU2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms