Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LctF8VPT3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LctF8VPT3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LctF8VPT3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms