Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21970F6XX07 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm21970F6XX07 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm21970F6XX07 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms