Protein–RNA interactions for Protein: F6VWU8

Zfp946, Zinc finger protein 946, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp946F6VWU8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp946F6VWU8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp946F6VWU8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp946F6VWU8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp946F6VWU8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp946F6VWU8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp946F6VWU8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp946F6VWU8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp946F6VWU8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zfp946F6VWU8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Zfp946F6VWU8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms