Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pagr1bF6V0H0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pagr1bF6V0H0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms