Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28305F6U473 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28305F6U473 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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