Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf212F6TQD1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms