Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp17lbE9Q9U0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp17lbE9Q9U0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp17lbE9Q9U0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp17lbE9Q9U0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp17lbE9Q9U0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp17lbE9Q9U0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp17lbE9Q9U0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp17lbE9Q9U0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp17lbE9Q9U0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp17lbE9Q9U0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
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