Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9N3

Vmn1r152, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r152E9Q9N3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vmn1r152E9Q9N3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r152E9Q9N3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms