Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Usp31E9Q6Y8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp31E9Q6Y8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp31E9Q6Y8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms