Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UtrnE9Q6R7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UtrnE9Q6R7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UtrnE9Q6R7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UtrnE9Q6R7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UtrnE9Q6R7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UtrnE9Q6R7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UtrnE9Q6R7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UtrnE9Q6R7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UtrnE9Q6R7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UtrnE9Q6R7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UtrnE9Q6R7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms