Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Simc1E9Q6E9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Simc1E9Q6E9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Simc1E9Q6E9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms