Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtproE9Q612 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PtproE9Q612 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtproE9Q612 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtproE9Q612 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
PtproE9Q612 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtproE9Q612 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtproE9Q612 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PtproE9Q612 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PtproE9Q612 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtproE9Q612 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
PtproE9Q612 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtproE9Q612 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtproE9Q612 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PtproE9Q612 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtproE9Q612 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PtproE9Q612 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtproE9Q612 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PtproE9Q612 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PtproE9Q612 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PtproE9Q612 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtproE9Q612 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PtproE9Q612 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtproE9Q612 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms