Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip11E9Q512 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip11E9Q512 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms